1999年，某样东西被用卡车运出立山市。几天后，哥斯拉登陆关山，特胜自卫队对其展开苦战。在战斗中，自卫队队员家城茜（由美子饰）突发杀死了战友叶山少尉（森真嗣饰），但他活了下来，被送到了情报科。另一方面，日本政府在首相智子哲（水野久美饰）的指挥下，召集汤原德光（大泷信孝饰）等科学家研究对抗哥斯拉的G武器。以关山冲挖掘出的第一代哥斯拉的骨骼为基础，他们花了4年时间打造了一只机械哥斯拉3型机器龙。哲智首相辞职，科学技术厅长官五十岚隼人（中尾彬饰）就任新首相。同时，曦被派往机龙队，担任机龙的操纵者。在准备测试机动时，哥斯拉再次出现在东京湾。机龙赶到现场与哥斯拉战斗，却因哥斯拉的怒吼唤醒了体内的兽魂，突然暴走，给城市造成了巨大的破坏。为了改进机龙，汤原改变了机龙DNA计算机的基础结构，使机龙不再受到哥斯拉的叫声干扰。但由于担心再次暴走，五十岚没有允许飞机升空。哥斯拉再次出现在东京湾，无视特胜自卫队的进攻，一路冲向品川，将城市变成一片火海。针对这样的情况，五十岚最终同意让机龙出去。为了打败哥斯拉，基隆被派往品川。茜也有死亡神智。姬龙和熙的战斗就是这样开始的。暂时没有网友评论该影片